План на курса

Въведение в Fiji и ImageJ

  • Общ преглед на Fiji и неговите приложения в научната изследователска дейност
  • Разбиране на архитектурата на ImageJ и добавките
  • Инсталиране и настройка на Fiji за оптимална производителност

Основни техники за обработка на изображения

  • Придобиване и импорт на формати на изображенията
  • Регулиране на контраста, яркостта и прилагане на филтри
  • Стакане и проекция на изображения

Напредъчен анализ на изображенията

  • Техники за сегментация: порогово задаване и детекция на ръбовете
  • Броене на обекти и анализа на частици в истологични образци
  • Измерване на области, периметри и други морфологични характеристики

Работа с биологични образци

  • Обработка на изображения на истологични тъкани, кръвни клетки и водорасли
  • Деконволюция на цветовете и анализа на разцветените тъкани
  • Анализ на времеви редове и отследяване на движението на клетки

Автоматизация и персонализация

  • Създаване и изпълнение на макроси за повторящи се задачи
  • Използване на добавки за Fiji за специализирани анализа
  • Основно скриптиране с езика за макроси на ImageJ (IJM)

Управление на данни и докладване

  • Експортиране на резултати и генериране на доклади
  • Анотиране на изображенията и приготвка на данни за публикуване
  • Най-добрите практики за възпроизводим анализ на изображения

Резюме и следващи стъпки

Изисквания

  • Основно разбиране на концепциите за биологичната визуализация
  • Запознаност с микроскопията и истологичните техники
  • Основна компютърна грамотност

Целева аудитория

  • Научни изследователи в биотехнологията и околната токсикология
  • Лабораторни техники, работещи с истологични и клетъчни изображения
  • Учените, заинтересовани в количествен анализ на изображенията
 14 часове

Брой участници


Цена за участник

Предстоящи Курсове

Свързани Kатегории