Microbial Genomics обучение в Пловдив

Микробната геномика и метагеномика комбинират технологии за секвениране и компютърен анализ, за профилиране на микробни общности, характеристизиране на геноми и откриване на функционални свойства като антимикробна устойчивост.

Този курс, воден от инструктор (онлайн или на място), е предназначен за начинаещи до средно ниво изследователи и биоинформатици, които желаят да извършват ръчен анализ на данни за секвениране на микробна геномика и метагеномика.

След края на този курс участниците ще могат да:

• Описват общо използвани работни процеси и ключови файлови формати, използвани в микробната геномика.
• Извършват контрол на качеството и предварителна обработка на сурови NGS четения.
• Извършват таксономично профилиране с маркиращи и k-mer подходи.
• Събират и анотират микробни геноми и плазмиди.
• Откриват SNP, изграждат филогении и интерпретират популационната структура.
• Предсказват антимикробно устойчиви гени и резюмират функционални профили.
• Използват повторими работни процеси с Conda, Docker и ноутбук-базирани отчета.

Формат на курса

• Лекции, представящи концепции и инструменти (20%).
• Практични сесии с ръчно извършване с примерни набори от данни (60%).
• Отворени дискусии и ръководено анализиране, така че участниците да прилагат методите към своите данни (20%).

Опции за персонизация на курса

• За да попитате за персонализиран уебинар, фокусиран върху клинична, екологична или индустриална метагеномика, моля свържете се с нас за уреждане.